Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXL4Q9UKA2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FBXL4Q9UKA2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms