Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBE1Q9UJT0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms