Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCSK1NQ9UHG2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms