Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFT172Q9UG01 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms