Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NKX1-2Q9UD57 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms