Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
REV1Q9UBZ9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms