Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APEX2Q9UBZ4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms