Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHRF1Q9P1Y6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms