Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SDHAF3Q9NRP4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms