Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASCL3Q9NQ33 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms