Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
POLR1EQ9GZS1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR1EQ9GZS1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms