Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCAPERQ9BY12 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCAPERQ9BY12 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms