Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TIMM29Q9BSF4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TIMM29Q9BSF4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms