Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD2Q9BSE4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD2Q9BSE4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms