Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC38A2Q96QD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms