Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NLRP3Q96P20 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms