Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SFXN2Q96NB2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms