Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SCMH1Q96GD3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms