Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SGF29Q96ES7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms