Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOPBP1Q92547 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPBP1Q92547 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms