Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM9SF4Q92544 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TM9SF4Q92544 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms