Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAJA4Q8WW22 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA4Q8WW22 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms