Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SEMA6DQ8NFY4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEMA6DQ8NFY4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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