Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AMER3Q8N944 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms