Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms