Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC84Q86UT8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms