Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3T8

ZFYVE16, Zinc finger FYVE domain-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE16Q7Z3T8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZFYVE16Q7Z3T8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZFYVE16Q7Z3T8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms