Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC46A3Q7Z3Q1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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