Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF550Q7Z398 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms