Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRCQ7RTU9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms