Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMBR1LQ6UX01 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMBR1LQ6UX01 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms