Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TSSK4Q6SA08 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms