Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms