Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms