Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEP350Q5VT06 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms