Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIF1Q5UIP0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIF1Q5UIP0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms