Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PAN3Q58A45 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PAN3Q58A45 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms