Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SFT2D3Q587I9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms