Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SP6Q3SY56 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SP6Q3SY56 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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