Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms