Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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PTPRNQ16849 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRNQ16849 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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