Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HADHQ16836 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HADHQ16836 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms