Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUSP6Q16828 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms