Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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HIST2H2BEQ16778 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HIST2H2BEQ16778 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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