Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDK4Q16654 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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