Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZIC1Q15915 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms