Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EFNB3Q15768 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
EFNB3Q15768 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms