Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALX1Q15699 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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