Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PCLAFQ15004 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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