Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALCAMQ13740 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
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